La enseñanza y el desarrollo del Programa se basan en el sistema tutoral que tiene las siguientes características:
- Todos los alumnos inscritos de maestría y doctorado tienen asignado un tutor principal, y los de doctorado un comité tutoral.
- El tutor principal tiene la responsabilidad de establecer, junto con el alumno, el plan individual de actividades académicas que este seguirá, de acuerdo al plan de estudios, y dirigirá la tesis de grado o supervisará el trabajo de preparación del examen general de conocimientos.
- El comité tutoral conoce y avala el proyecto de tesis y el plan de actividades académicas que debe cumplir el alumno de doctorado, y evalúa semestralmente su avance.
- Cada comité tutoral se integra con tres tutores acreditados en el programa, uno de los cuales será el tutor principal.
Los tutores son profesores o investigadores de tiempo completo de la UNAM o de otras instituciones académicas que cumplen los requisitos de calidad y desempeño académicos que establece el Reglamento General de Estudios de Posgrado y el Plan de Estudios del Programa y que son acreditados expresamente por su Comité Académico.